Entry information : TsAPx-R (Thhalv10025686m)
| Entry ID | 9804 |
|---|---|
| Creation | 2011-11-18 (Qiang Li) |
| Last sequence changes | 2011-11-21 (Qiang Li) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2015-12-30 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: TsAPx-R (Thhalv10025686m)
| Name (synonym) | TsAPx-R (Thhalv10025686m) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Ascorbate peroxidase related [Orthogroup: APx-R001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Eutrema | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Thellungiella salsuginea (Eutrema salsugineum) [TaxId: 72664 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '9804' 'complement(join(3287221..3287323,3287410..3287476,3287602..3287723,3287810..3287893,3287985..3288081,3288160..3288202,3288327..3288397,3288536..3288651,3288749..3288845,3288921..3289113))' |
Exons►
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Literature and cross-references TsAPx-R (Thhalv10025686m)
| Literature | Taji,T., Sakurai,T., Mochida,K., Ishiwata,A., Kurotani,A., Totoki,Y., Toyoda,A., Sakaki,Y., Seki,M., Ono,H., Sakata,Y., Tanaka,S. and Shinozaki,K. BMC Plant Biol. 8, 115 (2008).
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|---|---|
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_1 (3289113..3287221) |
| EST ref. | GenBank: BAJ34274 |
Protein sequence: TsAPx-R (Thhalv10025686m)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic and 1 EST. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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