Entry information : TsAPx07 (Thhalv10028741m)
| Entry ID | 9809 |
|---|---|
| Creation | 2011-11-18 (Qiang Li) |
| Last sequence changes | 2011-11-21 (Qiang Li) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2015-12-31 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: TsAPx07 (Thhalv10028741m)
| Name (synonym) | TsAPx07 (Thhalv10028741m) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2004] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Eutrema | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Thellungiella salsuginea (Eutrema salsugineum) [TaxId: 72664 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '9809' 'join(11333075..11333164,11333248..11333352,11333492..11333576,11333663..11333763,11333840..11333880,11333961..11334091,11334179..11334285,11334358..11334495,11334571..11334705,11334786..11334896)' |
Exons►
|
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Literature and cross-references TsAPx07 (Thhalv10028741m)
| Literature | Taji,T., Sakurai,T., Mochida,K., Ishiwata,A., Kurotani,A., Totoki,Y., Toyoda,A., Sakaki,Y., Seki,M., Ono,H., Sakata,Y., Tanaka,S. and Shinozaki,K. BMC Plant Biol. 8, 115 (2008). |
|---|---|
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_3 (11333075..11334896) |
| EST ref. | GenBank: BAJ33725 |
Protein sequence: TsAPx07 (Thhalv10028741m)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic and 1 EST. Incorrect prediction from phytozome (extra 5' end has been removed). | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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