Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
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Length (aa): |
247 |
PWM (Da): |
26517.32 |
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PI (pH):
| 9.54 |
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Sequence 290
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GGESGPNTERTAGANFNLHRFEVIDDARxQLEAASPFVSCADILTLAARDSVLLVSKGQSWQVPTGRRD*RVSFSMSVDNLPSPSDSVAVQQRKFAAFKLKIMDFVNLIGGHTIGTAVPVCGFFTKRIFNTTGNTADPTMDQTFLPQLQRLCPQNGDxASRRMDLDAGMAILNFDTSFFNNLSRGRGILQSDQILWTNPTTR*LxSIVQEFMASRGNFNAQFAKSMVKMSNIGVKTGANGEIRRVCSAI |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Pseudogene from genomic. Incorrect prediction from phytozome (Long 5' end and PS in frame are missing which have been no found in genomic yet. Stop in frame.). No EST.
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DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GTGGTGAATCGGGACCTAACACTGAAAGAACCGCTGGTGCAAACTTTAACCTCCATCGTTTTGAGGTCATTGACGATGCCAGACGNCAGCTTGAGGCGGCAAGTCCTTTTGTCTCCTGTG CCGATATTTTAACCTTAGCGGCTCGTGATTCTGTCCTCCTCGTAAGTATACTTATACAAATATATATTATACAAAAGAGAACTAAAGAACTACATGTCTTGAAGGTTTTAAACGCCATTT TTTTTTTGCGTTTGGGTTTAGATACGAACTAGAAATAAAAAAAAATTATTTTCTTCTCAAAAATTATTTCACAACATATACGCAGGACCAGCCCAGAGCATAGACGAAGTAGGCGACGGA TTAGACCATCCAATTTACGGGAGCATATTTTGGTTAATTTTTTTTTTGTACAGAAATTATATATATATATATGTATATATATATAAACAAATTTAAAAGATTTTTTATAAGACAATAATA TTTGTAAATTTTTTTGTAATGTTTATGAACTTTTCTCTAAAAAAATATTGGTTAGAAGGGCAACAAATTATATTTTAGAAAGAAAATAGAATTTGTAGACTTGAAGGTTTCTTTAATGAA TGTTATGCAGATATAGTTGGTGATGATCTGTTTATGGAATTAGAAATTCTCCGAGAATTAATACCAAATGAAGTTGGGAAACTTATTGAAGTGCTTGATTTTTTGAAACAAATGGAAAAC ACAGAAGTTTCATATCGCATATTGTTGACAGTTCTAGTATCGGTTGCTACTGCTGAAAGAAGTTTTTCGAAGTTAAAGCTGATAAAAATTATTTGCGATCTACCAAGAACGATTAAATGA ACTAACTTTGTTATCTATTGAGACAGCTATGTTGAAAAACTCGATTATGAGAGTTTAATAAACGATTTTGTAGGGAAAAAATACAAAAATGACCATATTTAATAATAAAATATTAGTTTT ATTGTGTTTTTTTGTATTTTTATAAACTATTTATGGAGTTGAAATATTTTATGATTTTTTCTTTTTTTTGTTTTTGTATTATTTGTTATTTTGAAAAAAAAAATTTTAAAAAAATTATAT TTAAAATTTTAGATTATAGCATTTAAATTTTAGACCAGAGCATTTAAATTGATTAATCCGGCACTGCATATACGCCTAAATGCAAACAGTGTGTTTTTTTGTTTACCGTTTATGTTTAGA ATTATAAACTGAAAATTAACCTAAAAATTGTTGATTCCTATGAAAAAAGATACACTACATGTACGTTAAACCATAAATATGGCCTTCGAAATACATCGAAAGAGATTTTAATCAAACATT ACGATTAACATTTTACGTAGCGAAAAAAAGCCTTTGAGAGGCGATTCCCAGATCTACTTTTATTTTCCTTGCCGACAACAAAAAAAACATCTTCGATCTTCCTCTCCGGCGCGCGTGGTG GCTCACCGTCGCCGGAGGAGGGACCACGTTGACCTCCTCTTTCATTTGGTTGACTTGTTGTTGTGCTTGGCCGTTGGCTCGGTTGTGGTGTTAAAGTGAAGTTCTCCATCTCCAGCGTGT GTTTCTGGATCGACGGCGGCAGAGCCTCAGCGGCGTTGCTGGGGTTGTGGTGGTGGAAGGCTATCTCCTCGTGGTCATGTGTCTCTCCTCTGTTCGCCTCTTTCTTTGCTGGCGGTTTTC TTCTCTTTGGTGCTCACCGGCGTTTTCCTCCGGCGGTCTCCATCGGCTTTTCTTTGAGAGTCCTCGTCGCCGGTGACGTGCTCTCTGACTTTCCTCGGTGGTGATGCTCGTCTCTCCCTG TTTAAAGTTCCACTCTGCCTTGTTTTGCATATAGTGGTGTTCCCAAGGTGGAGGTGTGGTGGCGATGTAAGCTCTGGTCTCCTCGGCTACGGCGGCGGTGGTTTGGACCTCGAGGACGGG TTCAATCTCTGGTTCGGTATCTCAGGAGATGTTTTGCTTGTGGCTGGCCTCGGAGTGGTGGCTCTCGTTTTCCCGGCGTGCGCGGCTCCACCTGCTGTGTTTCTTGGCGGTGGCTCTAGG CGGGTGGCTCAGCGGCAGTTTCTCTCGGTTCGTCGGAGAAGCTCCGGCCGGTGCCGTCTTTTCACCGTTGTGGCTCAGGTTTTGCGGTAGGTGTGTGTGCTTGTTCTCGGCATTTTTTCA GCAGCTTCGCAGATTGGTCTTCGTCTTGGTTCGTGATGGCTCCGACTTAGTAGTTCGGTGTAGATGGTGGAGCGTCTCGAGACGTGTATTGTAGAGGTGCCGGTTTGTTGTTCGGTTAGG TTGCAACTGTGGAGGTTGGTCCTTATGGAGATTTCGGTTTCTACGGGAATGATTTTCGGAAGTGACCTCTCCGATTACCGCTCAGACTTCCTTGTCACCAGTTGTATTTTAGTCCGTTAT GCATTCCGGAGATTGCGTTAGTTCTCGGAGAAGCTGTAGGCGTCTCCTTCCGGCGGTTGGAGGATGCCTCGGATTGATGCTCGTGGCAACTATGATGTGAACTCCAGCTCTTTGAGCTGC AGCAAATACGGGATGGTCCGTGCTTTAGCACGTGATTGCTGCTTTCTCGTCTTGTTTTGCTTCGGTTTTATCTTTTTTGTTTCACTTACCGGTTCTTTACCTTTCTTTGTGTTTTTGTTG CTTCAATGTCGGTTTTCGTTTGTCGTAGATTTTAGTTTTCTGCTTTCTTTGTCGTACCTCTGTATTCTGTAAAAAATTTGAAAAAATTTGGTATAAAATTTAACATTTAACCAAAAAAAA AAAAAACATTTTACTTAGCTTTGCATGGGTGCATGCATGTAGACGTACGAAAGGACAAAGCTGGCAAGTCCCAACAGGACGTAGAGATTGACGAGTTTCCTTTTCAATGAGCGTTGATAA TCTTCCCTCTCCAAGTGACTCTGTCGCCGTTCAACAAAGGAAATTCGCTGCTTTCGCGATCTTGTCGCTCTCGTCGGTCAGTAATTTCACAAAACTAAAGATTATGGATTTTACAAACTA TTTTCAAATTATAATAGAGCTAATTGATTAGTTTAGATGGAAACAACAAACGTTTTACGTGGATCAGAATATTAACAATATTATATGGATATATGTAAATTTAATAGGAGGACACACGAT TGGAACAGCTGTGCCTGTGTGTGGCTTCTTTACGAAAAGAATATTTAATACTACCGGAAACACAGCAGATCCAACCATGGACCAAACATTCCTACCACAACTTCAAAGACTTTGTCCCCA AAACGGTGATACNGCATCTAGGCGCATGGATCTTGACGCTGGAATGGCAATACTTAATTTTGACACTTCCTTCTTTAACAATCTCAGCCGTGGCAGAGGCATTCTTCAATCCGATCAGAT TCTTTGGACTAATCCAACGACTAGATGACTAGANTCTATCGTGCAAGAGTTTATGGCTTCTAGAGGCAACTTCAATGCTCAGTTTGCGAAGTCGATGGTTAAAATGAGTAATATTGGTGT GAAAACAGGGGCAAATGGTGAAATTCGTAGGGTTTGTTCAGCT |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GTGGTGAATCGGGACCTAACACTGAAAGAACCGCTGGTGCAAACTTTAACCTCCATCGTTTTGAGGTCATTGACGATGCCAGACGNCAGCTTGAGGCGGCAAGTCCTTTTGTCTCCTGTG CCGATATTTTAACCTTAGCGGCTCGTGATTCTGTCCTCCTCGTAAGGAAAGGACAAAGCTGGCAAGTCCCAACAGGACGTAGAGATTGACGAGTTTCCTTTTCAATGAGCGTTGATAATC TTCCCTCTCCAAGTGACTCTGTCGCCGTTCAACAAAGGAAATTCGCTGCTTTAAAACTAAAGATTATGGATTTTGTAAATTTAATAGGAGGACACACGATTGGAACAGCTGTGCCTGTGT GTGGCTTCTTTACGAAAAGAATATTTAATACTACCGGAAACACAGCAGATCCAACCATGGACCAAACATTCCTACCACAACTTCAAAGACTTTGTCCCCAAAACGGTGATACNGCATCTA GGCGCATGGATCTTGACGCTGGAATGGCAATACTTAATTTTGACACTTCCTTCTTTAACAATCTCAGCCGTGGCAGAGGCATTCTTCAATCCGATCAGATTCTTTGGACTAATCCAACGA CTAGATGACTAGANTCTATCGTGCAAGAGTTTATGGCTTCTAGAGGCAACTTCAATGCTCAGTTTGCGAAGTCGATGGTTAAAATGAGTAATATTGGTGTGAAAACAGGGGCAAATGGTG AAATTCGTAGGGTTTGTTCAGCT |
Retrieve as FASTA
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