Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
247 (273) |
PWM (Da): |
26517.32 (29756.2) |
|
PI (pH): |
9.54 (8.82) |
Peptide Signal: |
cut: 27 range:27-299 |
|
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GGESGPNTERTAGANFNLHRFEVIDDARxQLEAASPFVSCADILTLAARDSVLLVSKGQSWQVPTGRRD*RVSFSMSVDNLPSPSDSVAVQQRKFAAFKLKIMDFVNLIGGHTIGTAVPV CGFFTKRIFNTTGNTADPTMDQTFLPQLQRLCPQNGDxASRRMDLDAGMAILNFDTSFFNNLSRGRGILQSDQILWTNPTTR*LxSIVQEFMASRGNFNAQFAKSMVKMSNIGVKTGANG EIRRVCSAI |
Retrieve as FASTA
|
|
Remarks |
Pseudogene from genomic. Incorrect prediction from phytozome (Long 5' end and PS in frame are missing which have been no found in genomic yet. Stop in frame.). No EST.
|
DNA ►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GGTGGTGAATCGGGACCTAACACTGAAAGAACCGCTGGTGCAAACTTTAACCTCCATCGTTTTGAGGTCATTGACGATGCCAGACGNCAGCTTGAGGCGGCAAGTCCTTTTGTCTCCTGT GCCGATATTTTAACCTTAGCGGCTCGTGATTCTGTCCTCCTCGTAAGAGTATACTTATACAAATATATATTATACAAAAGAGAACTAAAGAACTACATGTCTTGAAGGTTTTAAACGCCA TTTTTTTTTTGCGTTTGGGTTTAGATACGAACTAGAAATAAAAAAAAATTATTTTCTTCTCAAAAATTATTTCACAACATATACGCAGGACCAGCCCAGAGCATAGACGAAGTAGGCGAC GGATTAGACCATCCAATTTACGGGAGCATATTTTGGTTAATTTTTTTTTTGTACAGAAATTATATATATATATATGTATATATATATAAACAAATTTAAAAGATTTTTTATAAGACAATA ATATTTGTAAATTTTTTTGTAATGTTTATGAACTTTTCTCTAAAAAAATATTGGTTAGAAGGGCAACAAATTATATTTTAGAAAGAAAATAGAATTTGTAGACTTGAAGGTTTCTTTAAT GAATGTTATGCAGATATAGTTGGTGATGATCTGTTTATGGAATTAGAAATTCTCCGAGAATTAATACCAAATGAAGTTGGGAAACTTATTGAAGTGCTTGATTTTTTGAAACAAATGGAA AACACAGAAGTTTCATATCGCATATTGTTGACAGTTCTAGTATCGGTTGCTACTGCTGAAAGAAGTTTTTCGAAGTTAAAGCTGATAAAAATTATTTGCGATCTACCAAGAACGATTAAA TGAACTAACTTTGTTATCTATTGAGACAGCTATGTTGAAAAACTCGATTATGAGAGTTTAATAAACGATTTTGTAGGGAAAAAATACAAAAATGACCATATTTAATAATAAAATATTAGT TTTATTGTGTTTTTTTGTATTTTTATAAACTATTTATGGAGTTGAAATATTTTATGATTTTTTCTTTTTTTTGTTTTTGTATTATTTGTTATTTTGAAAAAAAAAATTTTAAAAAAATTA TATTTAAAATTTTAGATTATAGCATTTAAATTTTAGACCAGAGCATTTAAATTGATTAATCCGGCACTGCATATACGCCTAAATGCAAACAGTGTGTTTTTTTGTTTACCGTTTATGTTT AGAATTATAAACTGAAAATTAACCTAAAAATTGTTGATTCCTATGAAAAAAGATACACTACATGTACGTTAAACCATAAATATGGCCTTCGAAATACATCGAAAGAGATTTTAATCAAAC ATTACGATTAACATTTTACGTAGCGAAAAAAAGCCTTTGAGAGGCGATTCCCAGATCTACTTTTATTTTCCTTGCCGACAACAAAAAAAACATCTTCGATCTTCCTCTCCGGCGCGCGTG GTGGCTCACCGTCGCCGGAGGAGGGACCACGTTGACCTCCTCTTTCATTTGGTTGACTTGTTGTTGTGCTTGGCCGTTGGCTCGGTTGTGGTGTTAAAGTGAAGTTCTCCATCTCCAGCG TGTGTTTCTGGATCGACGGCGGCAGAGCCTCAGCGGCGTTGCTGGGGTTGTGGTGGTGGAAGGCTATCTCCTCGTGGTCATGTGTCTCTCCTCTGTTCGCCTCTTTCTTTGCTGGCGGTT TTCTTCTCTTTGGTGCTCACCGGCGTTTTCCTCCGGCGGTCTCCATCGGCTTTTCTTTGAGAGTCCTCGTCGCCGGTGACGTGCTCTCTGACTTTCCTCGGTGGTGATGCTCGTCTCTCC CTGTTTAAAGTTCCACTCTGCCTTGTTTTGCATATAGTGGTGTTCCCAAGGTGGAGGTGTGGTGGCGATGTAAGCTCTGGTCTCCTCGGCTACGGCGGCGGTGGTTTGGACCTCGAGGAC GGGTTCAATCTCTGGTTCGGTATCTCAGGAGATGTTTTGCTTGTGGCTGGCCTCGGAGTGGTGGCTCTCGTTTTCCCGGCGTGCGCGGCTCCACCTGCTGTGTTTCTTGGCGGTGGCTCT AGGCGGGTGGCTCAGCGGCAGTTTCTCTCGGTTCGTCGGAGAAGCTCCGGCCGGTGCCGTCTTTTCACCGTTGTGGCTCAGGTTTTGCGGTAGGTGTGTGTGCTTGTTCTCGGCATTTTT TCAGCAGCTTCGCAGATTGGTCTTCGTCTTGGTTCGTGATGGCTCCGACTTAGTAGTTCGGTGTAGATGGTGGAGCGTCTCGAGACGTGTATTGTAGAGGTGCCGGTTTGTTGTTCGGTT AGGTTGCAACTGTGGAGGTTGGTCCTTATGGAGATTTCGGTTTCTACGGGAATGATTTTCGGAAGTGACCTCTCCGATTACCGCTCAGACTTCCTTGTCACCAGTTGTATTTTAGTCCGT TATGCATTCCGGAGATTGCGTTAGTTCTCGGAGAAGCTGTAGGCGTCTCCTTCCGGCGGTTGGAGGATGCCTCGGATTGATGCTCGTGGCAACTATGATGTGAACTCCAGCTCTTTGAGC TGCAGCAAATACGGGATGGTCCGTGCTTTAGCACGTGATTGCTGCTTTCTCGTCTTGTTTTGCTTCGGTTTTATCTTTTTTGTTTCACTTACCGGTTCTTTACCTTTCTTTGTGTTTTTG TTGCTTCAATGTCGGTTTTCGTTTGTCGTAGATTTTAGTTTTCTGCTTTCTTTGTCGTACCTCTGTATTCTGTAAAAAATTTGAAAAAATTTGGTATAAAATTTAACATTTAACCAAAAA AAAAAAAAACATTTTACTTAGCTTTGCATGGGTGCATGCATGTAGACGTACGAAAGGACAAAGCTGGCAAGTCCCAACAGGACGTAGAGATTGACGAGTTTCCTTTTCAATGAGCGTTGA TAATCTTCCCTCTCCAAGTGACTCTGTCGCCGTTCAACAAAGGAAATTCGCTGCTTTTTCGCGATCTTGTCGCTCTCGTCGGTCAGTAATTTCACAAAACTAAAGATTATGGATTTTTTA CAAACTATTTTCAAATTATAATAGAGCTAATTGATTAGTTTAGATGGAAACAACAAACGTTTTACGTGGATCAGAATATTAACAATATTATATGGATATATGTAAATTTAATAGGAGGAC ACACGATTGGAACAGCTGTGCCTGTGTGTGGCTTCTTTACGAAAAGAATATTTAATACTACCGGAAACACAGCAGATCCAACCATGGACCAAACATTCCTACCACAACTTCAAAGACTTT GTCCCCAAAACGGTGATACNGCATCTAGGCGCATGGATCTTGACGCTGGAATGGCAATACTTAATTTTGACACTTCCTTCTTTAACAATCTCAGCCGTGGCAGAGGCATTCTTCAATCCG ATCAGATTCTTTGGACTAATCCAACGACTAGATGACTAGANTCTATCGTGCAAGAGTTTATGGCTTCTAGAGGCAACTTCAATGCTCAGTTTGCGAAGTCGATGGTTAAAATGAGTAATA TTGGTGTGAAAACAGGGGCAAATGGTGAAATTCGTAGGGTTTGTTCAGCT |
Retrieve as FASTA
|
|
CDS►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GGTGGTGAATCGGGACCTAACACTGAAAGAACCGCTGGTGCAAACTTTAACCTCCATCGTTTTGAGGTCATTGACGATGCCAGACGNCAGCTTGAGGCGGCAAGTCCTTTTGTCTCCTGT GCCGATATTTTAACCTTAGCGGCTCGTGATTCTGTCCTCCTCGTAAGGAAAGGACAAAGCTGGCAAGTCCCAACAGGACGTAGAGATTGACGAGTTTCCTTTTCAATGAGCGTTGATAAT CTTCCCTCTCCAAGTGACTCTGTCGCCGTTCAACAAAGGAAATTCGCTGCTTTAAAACTAAAGATTATGGATTTTGTAAATTTAATAGGAGGACACACGATTGGAACAGCTGTGCCTGTG TGTGGCTTCTTTACGAAAAGAATATTTAATACTACCGGAAACACAGCAGATCCAACCATGGACCAAACATTCCTACCACAACTTCAAAGACTTTGTCCCCAAAACGGTGATACNGCATCT AGGCGCATGGATCTTGACGCTGGAATGGCAATACTTAATTTTGACACTTCCTTCTTTAACAATCTCAGCCGTGGCAGAGGCATTCTTCAATCCGATCAGATTCTTTGGACTAATCCAACG ACTAGATGACTAGANTCTATCGTGCAAGAGTTTATGGCTTCTAGAGGCAACTTCAATGCTCAGTTTGCGAAGTCGATGGTTAAAATGAGTAATATTGGTGTGAAAACAGGGGCAAATGGT GAAATTCGTAGGGTTTGTTCAGCT |
Retrieve as FASTA
|
|