Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
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Length (aa):  |
247 |
| PWM (Da): |
26517.32 |
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| PI (pH):
| 9.54 |
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Sequence 290
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GGESGPNTERTAGANFNLHRFEVIDDARxQLEAASPFVSCADILTLAARDSVLLVSKGQSWQVPTGRRD*RVSFSMSVDNLPSPSDSVAVQQRKFAAFKLKIMDFVNLIGGHTIGTAVPVCGFFTKRIFNTTGNTADPTMDQTFLPQLQRLCPQNGDxASRRMDLDAGMAILNFDTSFFNNLSRGRGILQSDQILWTNPTTR*LxSIVQEFMASRGNFNAQFAKSMVKMSNIGVKTGANGEIRRVCSAI |
Retrieve as FASTA
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| Remarks |
Pseudogene from genomic. Incorrect prediction from phytozome (Long 5' end and PS in frame are missing which have been no found in genomic yet. Stop in frame.). No EST.
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DNA ►
Send to BLAST
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| .........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GTGGTGAATCGGGACCTAACACTGAAAGAACCGCTGGTGCAAACTTTAACCTCCATCGTTTTGAGGTCATTGACGATGCCAGACGNCAGCTTGAGGCGGCAAGTCCTTTTGTCTCCTGTG
CCGATATTTTAACCTTAGCGGCTCGTGATTCTGTCCTCCTCGTAAGTATACTTATACAAATATATATTATACAAAAGAGAACTAAAGAACTACATGTCTTGAAGGTTTTAAACGCCATTT
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GCAGCTTCGCAGATTGGTCTTCGTCTTGGTTCGTGATGGCTCCGACTTAGTAGTTCGGTGTAGATGGTGGAGCGTCTCGAGACGTGTATTGTAGAGGTGCCGGTTTGTTGTTCGGTTAGG
TTGCAACTGTGGAGGTTGGTCCTTATGGAGATTTCGGTTTCTACGGGAATGATTTTCGGAAGTGACCTCTCCGATTACCGCTCAGACTTCCTTGTCACCAGTTGTATTTTAGTCCGTTAT
GCATTCCGGAGATTGCGTTAGTTCTCGGAGAAGCTGTAGGCGTCTCCTTCCGGCGGTTGGAGGATGCCTCGGATTGATGCTCGTGGCAACTATGATGTGAACTCCAGCTCTTTGAGCTGC
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CTTCAATGTCGGTTTTCGTTTGTCGTAGATTTTAGTTTTCTGCTTTCTTTGTCGTACCTCTGTATTCTGTAAAAAATTTGAAAAAATTTGGTATAAAATTTAACATTTAACCAAAAAAAA
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TCTTCCCTCTCCAAGTGACTCTGTCGCCGTTCAACAAAGGAAATTCGCTGCTTTCGCGATCTTGTCGCTCTCGTCGGTCAGTAATTTCACAAAACTAAAGATTATGGATTTTACAAACTA
TTTTCAAATTATAATAGAGCTAATTGATTAGTTTAGATGGAAACAACAAACGTTTTACGTGGATCAGAATATTAACAATATTATATGGATATATGTAAATTTAATAGGAGGACACACGAT
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TCTTTGGACTAATCCAACGACTAGATGACTAGANTCTATCGTGCAAGAGTTTATGGCTTCTAGAGGCAACTTCAATGCTCAGTTTGCGAAGTCGATGGTTAAAATGAGTAATATTGGTGT
GAAAACAGGGGCAAATGGTGAAATTCGTAGGGTTTGTTCAGCT |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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| .........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GTGGTGAATCGGGACCTAACACTGAAAGAACCGCTGGTGCAAACTTTAACCTCCATCGTTTTGAGGTCATTGACGATGCCAGACGNCAGCTTGAGGCGGCAAGTCCTTTTGTCTCCTGTG
CCGATATTTTAACCTTAGCGGCTCGTGATTCTGTCCTCCTCGTAAGGAAAGGACAAAGCTGGCAAGTCCCAACAGGACGTAGAGATTGACGAGTTTCCTTTTCAATGAGCGTTGATAATC
TTCCCTCTCCAAGTGACTCTGTCGCCGTTCAACAAAGGAAATTCGCTGCTTTAAAACTAAAGATTATGGATTTTGTAAATTTAATAGGAGGACACACGATTGGAACAGCTGTGCCTGTGT
GTGGCTTCTTTACGAAAAGAATATTTAATACTACCGGAAACACAGCAGATCCAACCATGGACCAAACATTCCTACCACAACTTCAAAGACTTTGTCCCCAAAACGGTGATACNGCATCTA
GGCGCATGGATCTTGACGCTGGAATGGCAATACTTAATTTTGACACTTCCTTCTTTAACAATCTCAGCCGTGGCAGAGGCATTCTTCAATCCGATCAGATTCTTTGGACTAATCCAACGA
CTAGATGACTAGANTCTATCGTGCAAGAGTTTATGGCTTCTAGAGGCAACTTCAATGCTCAGTTTGCGAAGTCGATGGTTAAAATGAGTAATATTGGTGTGAAAACAGGGGCAAATGGTG
AAATTCGTAGGGTTTGTTCAGCT |
Retrieve as FASTA
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