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Search the protein database using a translated nucleotide query

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PEP: all PEP sequences in Redoxibase
DNA: all DNA sequences in Redoxibase
cDNA: all cDNA sequences in Redoxibase
CDS: all CDS sequences in Redoxibase
Promoter: all Promoter sequences in Redoxibase
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blastn tblastn blastp blastx

NB : In case your sequence is DNA and contains ambiguous characters as [Y,R,M,K,S,W] try this page

Blast Organism masking

Subextraction of organism

Medicago truncatula (barrel medic) in selected bank

Other Organisms

Organisms:

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Paste your sequence here (fasta or raw sequence)

ATGGCTAAGAATAGTGCTTCCATCACTTCTTTCTACTCTTTTCTTTTGATATCTTCCATTCTATTTGCTTCATACTTTCATGCCTCAAAGGCACAAACCAATGCCCCACCAGCAGTAAAAGGGTTGTCCTATGGTTTCTTTGCCCAAACATGTCCTAACCTTGAAAACATTGTGAGAAAACATCTCACTAAGGTGTTCAAATCAGACAATGGCCAAGCTCCTGGCTTACTTCGTATCTTCTTTCATGATTGCTTTGTTCAGGTAATTATATTAAAGTGCAATTTAAAGTGAAGAATAACAAAGACTGAATTGAAATTGAGTTTAGTAGAAGAGACTAAACTTATATAACATGACGAAACAATTGTCCGAATCTCGAAATATATACGGGCCAAGGTTTAATCCATGGTGGGGTCCATTGGGAAAAAATATCAACATAAAATAAGGATTTAGTTGATATGTTTTGACTCTTGAAATATATACTAACCTATTTTGGTTTAGTTGTGTTGGCTTAAAATTTTGGAGTTTGCTTTTTTCAAGTTTTTAGTTTTGATTTTCCATATGAATTTTGTTAGGTTAGTTTAACTTTTTCAAAAAATATTGTATCTATGCGAAAATTCATACAATAATGATTTGTAATTGATTGAATATTTTTATTCACCGAGCCTAAAATTTAATATTATTAATTACTCTTATATTATTACAGCGAGTGGATCCTCTCTCGTGGAGATCCCTCCTATCTTCTGGAGTGCCCCACTATATCCACCTTTAATTACACTCTCCTTTTTTTGATATTACAAACACATTATCTCACTTATTACAAACTTGTATATGATCTAGTTAATTTTCCTAACAACTTTTTATATTCTAAAGTTTTCTTGCATGACTTAGTAGTTGATATATATGTATGTAGGGATGTGATGGATCAGTGCTACTGGATGGAAAGCCAGGAGAAAGAGATCAACCACAAAATGGAGGCATGAGAACAGAAGCTTTGAAAACTATTGATGATATTAGGGCTCTTGTCCATAAAGAGTGTGGAAGGATTGTTTCTTGTGCAGATATCACTGTCTTGGCTGGCCGTGAAGCTGTTTTCCTAGTAAACTCTATACTCCATTTTACTTTTATTTTATATAACTTTTTTTTGGTACATAATTATTTTTCTTACTAATCATGTTTTTGATGTTTTGTACATATATTACTATTATAAAAAATTGAATTAACAGTCCCCTTGAGCATAACTCAGTTGGCAGAAACATACATTATTATATGCAGAGGTCGGGGTTCGAACTCCGGACACCCCCATTTATTCACCTTGAAAAAGGTGAATTATAGCCACTAGGCTATTTGACCAAAAAAAATTAAAATAACAAAAAAAATTAAATTGGTCATCAAATTTTTTAAACAAATTTTATCTTTTTTCATAATATATATATATATATAATAAAAAGTCATGTGAAGTGTCCCCTGAGCATAGCTCAGTTGACAGGGACATACATTATTATATGCAGAGGCCCGAGTTTGACCCTCGGACATCCCACTTATTAACATTAAAAAGGGTGAATTTTAGCCACTAAAATACTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTCATGTGAAGTTATGGTGAGAGTATAGTTTATATTATTTTCAAAGAAAATAGGAGACAGTGGTATCATTTCATAGACCTTTGTTGTAACATTAAATAGCTATTAACTATAAGTTTATTATAAAAGTTATTAATATTGTGAATCCAAAAAAAAAAAATATTATTCATTTTAGTAGTATCTAAACTTCACTTGTCATGAAAATAAAATATCACTACTAGTCACAACACACACACATATAAATATATAAAATAGTTTCTTATACATATATAGTACCGTTGATGCAGACTTAATCAAGATTGTGACCGAGTGAGTTTTACTTGTAAGATTATAGATTTAAATATTAATGCCCACTAGTTAATTCGACAACTGATCAGTAGGTAAAAATTACAGGAATAGAAAGAAAAAAATACGCAGCTAATTAAAAATTTATTTTGATTGACACATATTAATTAAGCAATGATATTGGTACAACCATTTGATAATAATTTATTGAACAATTTCTTCTTATCTCTTATTATTTTGTCAAAAATACTAAAGAGAAGAAGTAAAAACAAAATAAGAGTAAGAGAAACGGTTTTTCAAAAGTTATACCAGAGAATATGATTAGTTTATTAAGATCGCTGGTACTAAAAAACTTGAGTCTTTTTTTAATTACAAAATATTGACAAAGATTTTTCTGACAAACATTTTCTCACAATGTTAAATAATCGAGTTATAAACATTTGATATATACAAAATGCGAACATAGAGTTGAGTCTACTATAAAATATTAGACTTTCATGATATGACAAACAATTATTCTGATATCAATAGACAATGATGCATGTGTTTAATCGATGTTCAACAATATGCTCAATCTAATTATCTCGAATGTATGCTAACTTAGAAAATCAAACAAAATGTAATTTTTTTTAGAGGAAAATATTTAGCTAAAAACATTATAAAATATTTTACGCGGGGCCAGTCATTCAAAAAATTTATGATTATATATATATAGATAGATAAGTATATTCTTTCACAGCACATAAAAATTAGGCCACTTGATCAAAGACTTAGGTTTTTTCTCCCAACCAAAGTCTTGCTAGAAACCTAGAATATTAATTATCTTCAAAAAAAAAATTATCTCAAAGGCACAAACCCACGTTGCAAGACTCAAAAGTAAACTTTAATTATTATTTTTCAGACAATTGTTCTAACAACTTTTGACCTTTTCTTTTGTTTGACAACTCTTTTGTCATTTTCTAATCCTCAAACTTTAAAGTATTGTTAACTTTTTACATTATTCTATTCTTAGTTTTAATTTTCTAAATATGCTTTACCTAAAGGTTATATTTTATATTGACTATGCTAATACAGCTTTTTAGTAATATAATTATATTAGAAGACAGCTTTAAGAAAAGAGATAAGGATTGAGTTATTTTTGTTGATACATGTGAAAAATGATGCTAATCCTAGATAAAACCTAATATATAGAATCAAAAGCATCTTCTATCCCAAAAATAAATTAATGAAAAGCATATTTCAAAAGCCTGCTTGTATTTGATTTTTCTACTTGCATTGGACTTTGGATGTCTAAAATCGATTATACCACCAAAAGTTGCAAGATTGAACTTTGGAAATAATTGTCTACAAAAGAGTAGTTCAATGATTTCATTTGATTCTCTGCTACCAACAATAATTCTTCTCCTGTAAAAATTACGAGTCTGGTTAAGGAGTGTTCTAAGAAGCGTCCACTGATCAATGAATTGAGTAGTAAACTATTTATTAAAAAATCAAACACTTCAATTTTTAATGCATTAAATACACAAGTTTCAAAGTTACAAGATCATCAACTTATTATTTCTGACACTCGAAGAATGTCCTTAGGACACTTGTATGCATTTACCTAAACCTATTTATCAATATTTGTTTTTAATTTTTTTTTTAAATAATGGCATTTGGATGAACAAATTTGATACTATTCCAACACTATTTGGCATCATGGTAAAAAAAAAAAAAAACAAATATATAATATTATTCTTTTTCTTAAAAAAACTCGGTATCCGATCCAAGTACCGACTAATCTGATATTTAATATTATTCTTAATTGCAAATTTTTCATTTTCTAACCATGATTTCTCTCTTTTACCTTACCAGTCAGGAGGACCCAATTTTCCAGTACCACTAGGAAGAAAAGATGGAACATCTTTTAGCATAAAAGGAACAAGTAACCTACCCCAACCATTCAACAAAACAGATGTTACACTCAAAGTTTTTGCAGCCCAAAACTTTGATGTCACAGATGTTGTTGCATTATCAGGTGCACACACATTTGGTCGTGCACATTGTGGAACATTCTTCAATAGACTCTCTCCAGCGGACCCTACATTGGACAAAACCCTAGCTCAAAACCTTAAAAACACTTGCCCTAATGCAAATTCAGGTAACACTGCAAACCTAGACATAAGGACCCCGGCAACATTCGACAACAAATACTACCTTGATTTGATGAACAAACAAGGTTTGTTCACTTCCGACCAAGATTTGAACATTGATTCGAGGACGAAGGGTTTGGTTAATGATTTCGCTGTTAATCAGGGTTTGTTCTTTGAGAAGTTTGTTAATGCTTTTATTAAGGTGAGTCAGTTGAATGTTTTGGTTGGAAATCAAGGTGAAATTCGTGGTAAATGTAATGTGGTAAATGGTGGTAAGAAATCTGTTTTGTCTACTTTGGTGGAAGAGGGAATGGACTTGATTGAGCAATTTTAA

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